Ο κύριος λόγος που η kombucha υποστηρίζει την πέψη είναι επειδή περιέχει υψηλά επίπεδα διαφόρων οξέων, προβιοτικών, αμινοξέων και ενζύμων. Ορισμένες έρευνες έχουν δείξει την ικανότητά της να προλαμβάνει και να θεραπεύει έλκη στομάχου. Μπορεί επίσης να βοηθήσει να σταματήσει η Candida από υπερπληθυσμό μέσα στο έντερο αποκαθιστώντας την ισορροπία στο πεπτικό σύστημα. Αυτό επιτυγχάνεται με την δράση των προβιοτικών. Στο βλενογόννο του εντέρου αποκαθίστανται τα ωφέλιμα προβιοτικά βακτήρια ενώ εξαφανίζεται η ζύμη candida. Επίσης, αν και η Κομπούχα είναι προϊόν ζύμωσης βακτηρίων, ανταγωνίζεται τα παθογόνα στο έντερο και στο πεπτικό σύστημα.
